深圳市南頭中學的“始祖”是興建于1801年的鳳岡書院，已有200余年歷史。書院1906年改名為鳳岡學校，增設了近代自然科學、社會科學等科目。深圳經濟特區成立后，南頭中學教學管理水平和教學質量優異。從1995年起，南山區先后投入近 6000萬元建設現代化新南中。學校占地約為52000平方米。

南頭中學是深圳市歷史最悠久的學校，其前身為鳳岡書院，始建于1801年，1906年改稱為鳳岡學校，被譽為“深圳教育的根”。

學校是南山區規模最大的公辦普通高中，是國家級示范性普通高中、廣東省一級學校、廣東省教學水平優秀學校，2021年獲得深圳市先進基層黨組織的稱號。

近年來，學校致力于建設“質量過硬、特色鮮明、開放包容、師生喜愛、社會認可”的好高中，努力讓每個學生都能成為最好的自己。由于歷史底蘊深厚，辦學質量穩步提升，學校深得市民信賴，不少深圳家庭一家幾代人都是南中校友，被傳為美談。

學校于2010年4月即成立了“學生成長支持中心”，通過成立一個中心(學生成長支持中心)，提供兩類支持(師長支持、朋輩支持)，實施三大教育(生命教育、生涯教育、自主教育)，建立四大體系(課程體系、輔導體系、實踐體系、咨詢體系)，搭建了完整的學生成長支持體系，努力實現學生全面而有個性地發展。學校擁有生涯規劃教育市級立項課題，并已完成結題，生涯規劃教育是學校的特色品牌。

2007年5月，南頭中學以高分順利通過了國家級示范性普通高中的督導評估驗收，并于2007年5月被正式授予牌匾。專家組在評估報告里認為南中有“兩個罕見”：一是抽查教師上課的優秀率之高是罕見的;二是專家型領導班子和學者型的教師團隊的構成是罕見的。

學校178名教師中，有博士1人，中學正高級教師1人，特級教師6人，全國優秀教師3人，省級以上優秀教師12人，深圳名師4人，市級以上優秀教師82人，省市區級學科帶頭人和骨干教師占教師總數的一半以上，高級教師比例已達60%。學校設有廣東省名師工作室1個，深圳市名師工作室1個。

作為一所老牌優質高中，南頭中學教師隊伍正氣足、有愛心、業務精、水平高，年齡結構合理。學校構建了“重師德、重業績、重能力、重貢獻”的教學評價機制和教師榮譽體系，充分激發了老師們敬業樂業的無限熱情。在南山區學校管理綜合評價中，南頭中學榮獲第1名(全區100家單位)，并獲得了南山區第五屆教育改革創新獎。